ＤＮＡでたどる日本人の成り立ち３　アイヌ民族に続いて、まだ十分調査が行われておらず、結論的なことはいえない段階のようですが、琉球民族についてのＤＮＡ分析を紹介します。崎谷満著『ＤＮＡでたどる日本人10万年の旅』より。
ＤＮＡでたどる日本人の成り立ち１から構成比を再録すると以下。
沖縄　 九州 　四国 　東海 　関東 　東北 　北海道
南　 北　 　　 　徳島　　静岡　 東京　 青森　 アイヌ
Ｃ３(旧石器シベリア)　　 0　　0　　　8　　　3　　 　2　 　　2　　　0 　　　13
Ｃ１(縄文期貝文文化)　あり あり　　4　 　10　 　　5　　　 1　　　8　　　　0
Ｄ２(縄文文化)　　　　　　4 　39　　26　　26　　　33 　　40 　 39　 　　88
Ｎ(ウラル系)　　　　　　　 0　　 0 　　4　　 　7 　　　2 　　　0　　　8　　　　0
Ｏ２ｂ(長江文明)　 　　　67　 30　　32　　33　　　36　　 34 　 31　　　　0
Ｏ３(華北)　　　　　　　　 あり 16　　26　　 21　 　20　　　23　　15　　　　0
琉球諸島は南北でヒト集団の構成に差が見られます。ここで北琉球は奄美諸島と沖縄諸島、南琉球は宮古諸島、八重山諸島、与那国島をさす。
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