しかし、この文明の先住人は母系制集団であった事に、ますます謎が深まります。

＞（中略）文字があったし（まだすべてが解読されていない）、十進法と六十進法を併用した計算処理もこなしている。けれども帝王崇拝の痕跡はない。そのかわりいくつかの進化した信仰が重なるように発展していた。
　そうした信仰をかたちづくっていた原住民はムンダ人やドラヴィダ人である。母系制の社会だった。父よりも母を重んじた。古代プーナの陶工たちのあいだでは最も大きな水瓶は女が作ったことがわかっている。このことは古代インド史を見るにあたって重要な視点を提供するもので、のちの古ウパニシャッドやジャイナ教や『マヌの法典』にも、この母系制が残響した。
中村元『インド古代史』1963 春秋社

しかし、ここまでの都市国家を機能させる為には、統合者（支配者）が必要なことは必然です。
『インド古代史』にあるように「ドラヴィダ人が母系制の集団」とされているまではその通りとしても、都市の形成過程でその母系制は無くなったと考えるのが普通だと思います。

ドラヴィダ人の母系制は、都市の肥大と共に変化したがどの様に変化したのか？
ますます謎が深まります。
（ミネ）